| 順位 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 一瀬 雅人(4) | 日本文理大 | 9'02"67 | |
| 2 | 小西壮太郎(2) | 日本文理大 | 9'06"57 | |
| 3 | 窪田 翔(3) | 中津東高 | 9'08"14 | |
| 4 | 木暮 歩夢(4) | 日本文理大 | 9'14"56 | |
| 5 | 山内 健宏(1) | 日本文理大 | 9'37"88 | |
| 6 | 小野 雄聖(2) | 日本文理大 | 10'07"35 | |
| 7 | 高倉 正成 | 日田市陸協 | 10'08"96 | |
| 8 | 松本 凱聖(2) | 中津東高 | 10'10"21 | |
| 9 | 安藤 海斗(3) | 柳ヶ浦高 | 10'15"44 | |
| 10 | 松金 拓海(2) | 中津東高 | 10'30"25 | |
| 11 | 藤垣 空我(3) | 中津東高 | 10'39"10 | |
| 12 | 上野 祐駄(1) | 中津東高 | 10'49"33 | |
| 13 | 奥田 悠人(1) | 柳ヶ浦高 | 11'05"16 | |
| 14 | 中熊 力輝(1) | 日本文理大 | 11'11"93 | |
| 15 | 梅木 涼(3) | 中津東高 | 11'24"19 | |
| 判田 誠太 | 日田市陸協 | 欠場 | ||
| 財津 広樹 | 日田市陸協 | 欠場 | ||
| 財前 大志 | 日田市陸協 |